2. Microbiología Molecular y Comunidades Microbianas
Enfoque
Integra técnicas de biología molecular, secuenciación de nueva generación y análisis computacional para caracterizar la composición y funcionalidad microbiana en distintos contextos. Esta línea busca establecer correlaciones entre los perfiles microbianos y procesos biológicos, clínicos o ambientales, aportando conocimiento aplicable a la salud, biotecnología y sostenibilidad.
Ejes de investigación
Donde la investigación se convierte en resultados reales
Aplicaciones
Diagnóstico molecular
Microbiología ambiental
Biotecnología microbiana
Desarrollo de bioindicadores funcionales
Salud pública
Temas de investigación vigentes
Proyectos activos en biotecnología, salud y biociencias con impacto académico y tecnológico.
1.- Caracterización molecular de microbiomas clínicos y ambientales mediante secuenciación 16S rRNA: revisión comparativa de diversidad, estructura y función microbiana
Descripción
La investigación abordará estudios basados en 16S rRNA que comparan comunidades microbianas presentes en ambientes clínicos (piel, cavidad oral, intestino, superficies hospitalarias) y en entornos ambientales (suelo, agua, aire). Analizará la diversidad microbiana, la estructura ecológica, los géneros dominantes y los factores ambientales o clínicos que moldean la composición del microbioma.
Objetivo
Identificar similitudes y diferencias en la diversidad microbiana entre entornos clínicos y ambientales, describiendo patrones ecológicos y su relevancia en salud pública, ecología y biotecnología microbiana.
Participa como:
2.- Resistencia antimicrobiana en el microbioma intestinal humano: revisión del resistoma, transferencia horizontal y perfiles moleculares basados en 16S y metagenómica.
Descripción
Revisión de estudios que evalúan genes de resistencia antimicrobiana (ARGs) presentes en el microbioma intestinal humano, su relación con el uso de antibióticos, dieta y hospitalización. Se analizarán mecanismos de transferencia horizontal, bacterias portadoras de ARGs y su conexión con infecciones oportunistas.
Objetivo
Describir el panorama molecular del resistoma intestinal humano y evaluar cómo la microbiota puede actuar como reservorio de resistencia antimicrobiana con impacto clínico y epidemiológico.
Participa como:
3.- Microbiomas en acuicultura: comunidades benéficas y patógenas en sistemas de cultivo de peces y camarón.
Descripción
Se revisarán microbiomas asociados a bioflocs, agua, sedimento y microbiota intestinal en peces y camarón. El estudio comparará perfiles microbianos benéficos (probióticos nativos) frente a patógenos como Vibrio, analizando mecanismos de protección, adaptación y mortalidad en cultivos.
Objetivo
Identificar microorganismos clave que mejoran la supervivencia y productividad acuícola, proponiendo estrategias microbiológicas para reducir mortalidad y dependencias de antibióticos.
Participa como:
4.- Biocontrol microbiano basado en probióticos: mecanismos genéticos, compuestos antimicrobianos y aplicaciones clínicas, agrícolas e industriales.
Descripción
Revisión sobre bacterias con potencial probiótico (Lactobacillus, Bacillus, Saccharomyces), su genómica funcional, producción de metabolitos antimicrobianos, interacción con patógenos, y resultados experimentales en humanos, animales y agricultura.
Objetivo
Analizar la evidencia científica que respalda el biocontrol mediante probióticos, su eficacia frente a antibióticos tradicionales y su potencial como herramienta biotecnológica sustentable.
Participa como:
5.- Biofilms bacterianos: revisión comparativa de mecanismos genéticos, bioquímicos y fisiológicos en su formación y resistencia antimicrobiana.
Descripción
La revisión analizará redes reguladoras (quorum sensing, operones de adhesión, matriz EPS), rutas metabólicas, sistemas de tolerancia al estrés y evolución del fenotipo biofilm en bacterias clínicas y ambientales.
Objetivo
Explicar por qué los biofilms presentan resistencia elevada frente a antimicrobianos y cuáles son sus implicaciones en salud pública, contaminación industrial y bioprocesos.